2004年以來，國家先后出臺了糧食直補等農業補貼惠農政策，這些政策對調動農民種糧積極性發揮了積極作用。但在實施過程中也逐漸暴露出一些問題和矛盾，應予以重視并逐步完善。為此提出如下建議：

開展農業補貼立法。迄今為止，我國農業補貼尚處于無法可依的局面，應制定農業補貼基本法，以保證農業補貼政策規范有效運行，從源頭上控制和防范農業補貼“范圍、方式、使用、監管”等方面存在的問題。

逐步提高補貼標準。盡管近年來糧食價格回升，但農業仍然處于弱勢，比較效益低，糧價增幅趕不上農資價格上漲的幅度。種糧農民期盼著“糧價高一點、補貼多一點、農資穩一點”。

核實面積，使種糧土地都享受國家補貼政策。一些地方實際耕地面積與享受財政糧食直補和農資綜合補貼面積有較大差距。主要原因有：一是2002年農業稅改革時瞞報、漏報計稅土地面積，形成“黑地”。二是新增開荒土地。三是治理空心村和關閉磚瓦窯形成復耕土地。這三種情況的土地沒能享受優惠政策。建議國土部門協同鄉鎮政府對瞞報、漏報耕地和其它“黑地”面積進行核實，將其納入農業補貼范圍。對新增、復耕土地，應予以鼓勵。

優化農業補貼結構，增強現代農業發展后勁。現行的農業補貼結構中，流通性補貼較多，生產性補貼較少。由于財力有限，在農產品價格補貼不斷增加的情況下，對農業基礎設施建設、農技推廣、農業培訓等方面的補貼就得減少，而這方面正是改造傳統農業，增強農業發展后勁的關鍵所在。

制定統一的補貼規程，實行惠民資金專賬管理。建議提高信息化工作水平，強化技術支持。統一種糧補貼工作規程，開通惠農資金專戶，使各項惠農資金納入統一管理，不同資金項目實行專帳管理。