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設計的蛋白質可在兩種結構間切換
美國華盛頓大學研究團隊受晶體管啟發(fā),設計出了可在兩種不同的完整結構之間切換的蛋白質,這些蛋白質有望在智能藥物遞送系統(tǒng)、環(huán)境傳感等領域大顯身手。相關論文發(fā)表于最新出版的《科學》雜志。
鉸鏈結構的多樣性和構型變化。圖片來源:《科學》網(wǎng)站
研究人員將深度學習和基于物理的算法相結合,設計出了具有兩種不同完整結構的定制蛋白質,確定了其結構,并測量了其運動方式。通過分析蛋白質的動力學和熱力學性質,研究人員還可微調分子的運動。
此前,科學家只能制造出含有一種穩(wěn)定構型的蛋白質。研究團隊指出,創(chuàng)造在兩種形狀之間切換的蛋白質需要一種新的多態(tài)設計方法。多態(tài)設計方法曾幫助科學家研制出了能發(fā)生極小形狀變化的蛋白質、能根據(jù)金屬離子的存在改變形狀的肽,以及能折疊成不同形狀的類似序列。
在最新研究中,借助羅塞塔雙態(tài)設計和人工智能工具,研究人員開發(fā)出一種鉸鏈樣蛋白質。這種“鉸鏈蛋白”在沒有配體時形成一種設計結構,在配體存在時形成第二種設計結構。
這種鉸鏈蛋白類似于晶體管,就像晶體管對電信號的流動作出反應并實施控制,這些蛋白質也可通過改變形狀,在分子水平上控制生物之間的相互作用。例如,在一種狀態(tài)下,蛋白質可能無活性或具有某種功能;而在另一種狀態(tài)中,它可能具有不同功能。這種在狀態(tài)之間切換的能力使蛋白質能對周圍的生物或化學環(huán)境作出動態(tài)響應。
這些蛋白質還能以可預測方式移動,將作為未來生物技術的關鍵組成部分,開辟一系列非凡的應用領域。
編輯:馬嘉悅