日本臺灣在高鐵方面合作經驗豐富。2007年正式通車、全長345公里的臺灣高鐵是日本新干線首次整體出口海外。不過日本媒體同時表示，臺灣高鐵目前虧損嚴重，“情況嚴峻”。臺灣引進日本新干線設備后，后期維護成本高，加上公司經營不善，目前累計赤字已近470億元新臺幣(約合93.9億元人民幣)，此前參股臺灣高鐵公司的一些股東已經向法院提出起訴。《日本經濟新聞》稱，作為日本新干線在海外唯一的“樣板工程”，臺灣高鐵經營狀況不佳，無疑會影響日本新干線的口碑。

日本共同社稱，臺灣是日本高鐵出口的“重要據點”，日本鐵路公司和設備商期望立足臺灣，進而參與高鐵國際競爭。報道特別指出，日本去年在印度尼西亞高鐵訂單爭奪戰中敗給中國，但政府和民間企業正吸取教訓，卷土重來，目前為向印度、美國等國出口高鐵項目而展開努力。